有了卵巢巧克力囊肿，女性可能不容易怀孕，差不多有一半以上的巧克力囊肿无法自行怀孕，但是也有一部分人可以怀孕，最关键的点是疾病的进展过程。在早期，仅仅只是形成巧克力囊肿，没有破裂，没有形成盆腔的粘连，这种巧克力囊肿完全可以自然怀孕。 如果发现有卵巢巧克力囊肿，没有及时去治疗，随着每次来月经，囊肿里面都有出血、压力增大，囊肿都会有微破口破开，囊肿里面的巧克力样的液体就流到腹腔，形成腹腔粘连，包括输卵管的粘连，输卵管伞的闭合、卵巢功能受抑制。随着病情的逐渐加重，怀孕的几率就逐渐减小。