巧克力囊肿是否能怀孕，需要根据疾病进展的程度。如果巧克力囊肿刚刚形成，囊肿才3cm，没有任何症状，囊肿也没有破过，没有影响到正常的解剖结构，输卵管通畅，功能正常，怀孕几率就很高。正常的夫妻同房一年怀孕的几率70%-80%左右。 如果巧克力囊肿病程进展比较晚，囊肿在腹腔里破裂，导致急性的下腹痛、发热、卵巢囊肿破裂后的黏液就对腹膜、对肠系膜、肠表面，包括输卵管系膜、输卵管、输卵管伞造成刺激。这种刺激时间长了就会形成粘连，输卵管不通畅，怀孕的几率就会下降。具体的几率与病情相关。