尿路感染时药物治疗无效，可能是由于以下因素所致：1、用药不当：若患者出现尿路感染后，服用的药物不正确，则治疗效果不佳。如患者存在细菌感染，则使用抗真菌的药物治疗无效。若患者存在真菌感染，则使用抗细菌药物治疗效果也不佳。若患者是由于炎症导致的尿路感染，但使用利尿药、排石药或镇痛药进行治疗而非抗生素，则无法完全控制炎症；2、细菌耐药：若患者已经使用针对细菌的抗生素，但细菌对此类抗生素已经耐药，也会导致治疗效果不佳；3、其他因素：若患者存在易使感染顽固的因素，如梗阻性的病因会导致局部尿液引流不畅，则患者服用药物进行治疗的效果不佳。