引起肾脏疼痛的原因如下：一、腰部疾病：门诊大量患者因肾脏疼痛而就诊，经过排查以后，发现70%-80%的患者并非肾脏疼痛，而是腰痛。腰痛的原因主要是因为腰肌筋膜炎、腰肌劳损，部分患者因外伤或腰椎病变而出现疼痛，建议患者转诊到骨科进行治疗。二、泌尿系统疾病：约占1/3的患者。1、结石，肾脏内存在多数或体积较大的结石时，通常会有肾脏、腰部的隐痛症状；2、肿瘤，由于肾脏出现体积较大的良、恶性肿瘤，也会导致压迫性疼痛，甚至恶性肿瘤会侵犯腰大肌，直接导致腰部出现难以缓解的疼痛；3、肾积水，由于积水导致肾脏内部压力增高，所以患者会出现腰痛的症状，需要对积水病因进行排查和分析。常见的原因包括输尿管的结石、息肉、肿瘤，膀胱肿瘤或前列腺增生等，需要根据积水的具体原因，进行对症的手术治疗，从而缓解腰痛、肾脏疼痛。