膝关节腘窝囊肿治疗一般就是两种办法，即穿刺抽液和手术治疗，这两种方法根据不同的情况有不同的选用。1、穿刺抽液：如果腘窝囊肿比较小，症状比较轻，时间比较短，可以做超声评估。评估完之后，可以在囊肿积液稍微多的地方，用稍粗的针头穿刺抽出胶冻状的液体。抽完之后，再用弹力绷带进行加压包扎，能减轻囊肿的压迫症状。但这种方法复发率比较高，还有一定的复发风险；2、手术切除：这适用于囊肿存在时间较长的患者，尤其是那些尝试过穿刺抽液但又复发的。这种方法的复发风险较低。术前可能需要做磁共振来评估囊肿的大小、位置以及与周围组织的关系。手术有两种方案，一种比较传统，从后面切一个大口子，把囊肿壁游离出来并切除，然后结扎。第二种方法是关节镜手术，从关节镜进入探查，取前方两口，内侧再取一个口。进入关节镜后，找到囊肿入口，扩大它然后切除囊壁。这种手术效果也不错。综上所述，腘窝囊肿有两种治疗方案可供选择。