左侧腘窝囊肿治疗有两种方式，具体如下：1、保守治疗：如果腘窝囊肿体积不大，没有任何症状，此时可以进行保守治疗，保守治疗主要是减少关节活动量。如果有关节炎应该进行关节炎的治疗，比如口服抗炎镇痛药物、营养关节软骨药物，氨基葡萄糖控制关节炎，关节积液减少，囊肿体积也会减少；2、手术治疗：应该避免长距离行走和过量关节活动，关节过量活动会导致腘窝囊肿增长，如果已经有症状，比如下蹲时后方酸胀、疼痛，影响关节活动，此时可以考虑手术治疗。手术主要是切除囊肿，有两种方式，一种是患者俯卧位，在膝关节后方腘窝部位做横向切口，找到囊肿后将囊肿完全切除，同时将后方关节囊进行紧缩，加强缝合，避免复发，这种手术切除囊肿比较彻底。但是由于腘窝部位软组织比较松弛，容易出现积血、感染、愈合不良等问题。另一种手术方式是在关节镜下将囊肿与关节腔交界处的关节囊打开，形成囊肿与关节腔的交通，这样囊肿内高压液体，就会进入到关节内逐渐被吸收，囊肿就会消失，是比较微创的方法。