头疼睡不着觉，原因是头疼这种症状造成大脑过度兴奋、生物钟的调节出现障碍，所以出现入睡困难、睡不着觉等情况。如果患者本身就有神经性头疼、偏头疼，以及其他原因造成的头疼，如果患有动脉硬化、高血压等基础病，控制得不好也可以造成头疼。头疼本身是一个临床的症状，原因和诱发因素也很复杂。在头疼的情况下，比如神经性头疼、紧张性头疼、偏头疼发作等，这时大脑内部的调节，即生物钟的调节等，就会出现紊乱、焦虑、过度的兴奋等，所以睡不着觉，入睡比较困难。头疼本身是一个症状，原因很复杂，可以有全身疾病的原因、神经性原因、血管神经性头疼原因，也可以有肿瘤、中风、炎症等诸多方面的病因，这些病因引起的头疼，在没有完全控制好的情况下，会引起睡眠障碍。应该先查明原因，对因治疗再加上积极的对症治疗，缓解头疼以后，生物钟的调节才能恢复正常，才能进入正常的睡眠状态。对因治疗，治疗好头疼，头疼缓解以后，才能够考虑到进入正常的自然睡眠的过程。在睡眠的过程中，可以适当由医师开具处方，采用安神、安眠的药物等进行助眠，也可以采用物理的办法，比如经颅磁刺激治疗等进行治疗，或者是进行按摩、针灸等措施，使患者改善睡眠。